La peculiare caratteristica della FederScout è la sua natura autenticamente federale. Ha in qualche modo anticipato la richiesta di decentramento e federalismo della Società attuale in quanto dal punto di vista amministrativo ed organizzativo le Associazioni Federate sono del tutto autonome, rispondendo quindi al meglio alle esigenze locali, demandando, invece, alla Federazione la propria rappresentanza Nazionale ed Internazionale, la Formazione dei Capi e l'organizzazione di tutto quello che è di interesse comune come, per esempio, incontri nazionali ed attività per i ragazzi di tutte le età quali : Vacanze di Colonia per i Castorini, CdA nazionali per i Lupetti, Campi Nazionali per Esploratori/Esploratrici/Guide, Rover Moot etc., o la partecipazione ad eventi Internazionali quali EuroCamp, Workshop, Indaba, Gemellaggi con Gruppi di altri paesi, Jamboree, etc. etc..
Tutto ciò senza che la FederScout si sovrapponga alle Associazioni locali, essendo uno strumento di collaborazione, Servizio e controllo della corretta applicazione del Metodo Scout in sede locale.
Altra caratteristica molto particolare, e che certamente non esiste nelle Associazioni, è che tutte le decisioni sono prese collegialmente. La struttura Federale è orizzontale e non piramidale. Gli organi Federali sono monocratici ed eletti dall'Assemblea per ogni ruolo e compongono un organo (Consiglio Federale) esclusivamente esecutivo. Tutte le decisioni di qualsiasi genere sono di pertinenza dell'Assemblea Federale o dei Comitati Tecnici, nei quali organi sono rappresentate tutte le Associazioni Federate. Per questa ragione quando viene presa democraticamente una decisione, questa è certamente una decisione di tutti.
L'esperienza FederScout deve essere considerata un laboratorio. Infatti la pratica di Associazioni che lavorano insieme pariteticamente da anni, superando difficoltà e differenze, nel rispetto reciproco più profondo anche sormontando resistenze ed egoismi e prestando la massima attenzione alle impostazioni e tradizioni degli altri, è un esempio concreto e verificabile di collaborazione tra organizzazioni autonome tra loro, ma unite dal fine comune e dalla consapevolezza di portare avanti i contenuti di un grande Movimento Mondiale.
Ciò ha permesso alla FederScout di trovare l'equilibrio di oggi che la fa crescere e guardare al futuro con sempre maggiore sicurezza e coscienza di sè.